當設備開啟的時候，進水閥要緩慢的打開，因為一旦開始的水量很大會使得沈陽反滲透設備的反滲透膜受到沖擊，沖擊力過大會將反滲透膜沖破。就算沖擊力不大時間長了也會損壞反滲透膜。

要注意好沈陽反滲透設備的內部壓力，凈水側的壓力要低于另一側的壓力。反滲透膜不能出現脫水，尤其是在設備停止使用的時候，不能造成反滲透膜的脫水，否則會對設備造成不可彌補的損傷。設備每隔一段時間就要清晰，將反滲透膜上邊過濾的物質都清洗下來，如果凈水的水源非常的臟，或者長時間使用之后，就必須進行清洗。

沈陽反滲透設備處理的原水水質的污染指數不能大于5，建議值一般是小于3。預處理時還應該考慮到進水的pH值和溫度。膜的透水量是隨著水溫的增高而增大的，但溫度過高可能會加快醋酸纖維素膜的水解速度是機膜變軟。